合作备忘录的签订为部门间进一步加深协作建立了长效机制，奠定了制度基础。备忘录进一步细化三方职责：广东检验检疫局实施规范化管理，重点抓好出口水产品质量安全；海洋和渔业局加强源头监管，重点抓好水产品源头质量安全；农业厅加强生产和经营环节监管，重点抓好水产养殖投入品质量安全。

    三方从广东省出口水产品质量安全工作和对外贸易的实际出发，就加强组织领导、细化工作职责和采取切实有效措施等方面拟订合作工作事项，主要内容包括：建立日常联络和召开联席会议机制；建立信息通报与资源共享机制；建立国外官方考察迎检协作机制；建立突发事件应急处理协作机制；相互协调各级政府、机构和部门间的工作等。特别是在出口水产品源头监管、渔业投入品监管、疫情疫病和有毒有害物质监控等方面开展合作；在发生渔业水域环境灾害、水产疫情疫病、药物和饲料及有毒有害物质污染等紧急突发事件时配合开展应急处置与应对工作。