海峡两岸关系协会会长陈云林2008年11月4日与台湾海峡交流基金会董事长江丙坤在台北签署了《海峡两岸食品安全协议》。全文如下：
　　为增进海峡两岸食品安全沟通与互信，保障两岸人民安全与健康，海峡两岸关系协会与财团法人海峡交流基金会就两岸食品安全事宜，经平等协商，达成协议如下：
　　一、信息通报
　　双方同意相互通报涉及两岸贸易的食品安全信息，并就涉及影响两岸民众健康的重大食品安全信息及突发事件，进行即时通报，提供完整信息。
　　针对前项查询请求，应迅速回应并提供必要协助。
　　二、协处机制
　　双方同意建立两岸重大食品安全事件协处机制，采取下列措施妥善处理：
　　（一）紧急磋商、交换相关信息；
　　（二）暂停生产、输出相关产品；
　　（三）即时下架、召回相关产品；
　　（四）提供实地了解便利；
　　（五）核实发布信息，并相互通报；
　　（六）提供事件原因分析及改善计划；
　　（七）督促责任人妥善处理纠纷，并就确保受害人权益给予积极协助；
　　（八）双方即时相互通报有关责任查处情况。
　　三、业务交流
　　双方同意建立两岸业务主管部门专家定期会商及互访制度，就双方食品安全制度规范、检验技术及监管措施进行业务交流及信息交换。
　　四、文书格式
　　双方信息通报、查询及业务联系，使用双方商定的文书格式。
　　五、联系主体
　　（一）本协议议定事项，由双方食品安全等业务主管部门指定的联络人相互联系实施。必要时，经双方同意得指定其他单位联系实施。
　　（二）本协议其他相关事宜，由海峡两岸关系协会与财团法人海峡交流基金会联系。
　　六、协议履行及变更
　　双方应遵守协议。
　　协议变更，应经双方协商同意，并以书面方式确认。
　　七、争议解决
　　因适用本协议所生争议，双方应尽速协商解决。
　　八、未尽事宜
　　本协议如有未尽事宜，双方得以适当方式另行商定。
　　九、签署生效
　　本协议自双方签署之日起七日后生效。
　　本协议于十一月四日签署，一式四份，双方各执两份。
　　海峡两岸关系协会 财团法人海峡交流基金会
　　会长 陈云林 　　　董事长 江丙坤
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